Jon chlorkowy jest głównym anionem płynu pozakomórkowego. Stężenie jego zależy głównie od podaży chlorków z pokarmami oraz utraty tego pierwiastka z moczem lub wydzielinami i wydalinami przewodu pokarmowego. Zmiany poziomu chloru są skorelowane ze zmianami poziomu sodu. Do jego wzrostu dochodzi w m.in. w hipernatremii i kwasicy nieoddechowej. Hipochloremię stwierdzamy w przypadkach hyponatremii oraz w zasadowicy niegazowej.